Església d’una sola nau, de planta rectangular i lleugerament trapezoidal, orientada a llevant i coberta amb volta de canó. A llevant s’obre un absis de planta quadrada, cobert amb volta de canó il·luminada per una finestra d’esqueixada simple, que avui fa les funcions de sagristia, separat de la nau per un mur. La forma trapezoidal de la nau i certes característiques dels murs suggereixen una transformació profunda de les estructures originals. La coberta del temple és d’un sol vessant, en haver-se sobrealçat per adaptar-la a les alçades de la casa a la qual s’adossa el temple per la seva façana nord. L’accés a l’església es fa per una porta rematada amb un arc rebaixat oberta a la façana oest, damunt de la qual hi ha una finestra i un ample campanar d’espadanya de dos ulls, rematat amb un ull de bou. Al paviment hi ha una data de reforma, del 1930. El lloc del Vilar és documentat el 929. L’apendici de Sant Miquel el trobem a partir de 1030 i l’església és esmentada el 1090, a l’acta de consagració de Santa Maria d’Organyà.